Искусственный белок поменял конформацию в ответ на повышение концентрации ионов кальция
Или при замене одной из аминокислот
Американские химики смоделировали и синтезировали несколько белков, которые переходили из одной конформации в другую при повышении концентрации ионов кальция. Две конформации отличались расположением одной альфа-спирали вблизи сайта связывания. Исследование опубликовано в Science.
С помощью алгоритмов машинного обучения химики умеют предсказывать аминокислотную последовательность белка по его трехмерной структуре (и наоборот). За развитие таких алгоритмов Нобелевскую премию по химии в этом году получили Дэвид Бейкер, Джон Джампер и Демис Хассабис (подробнее читайте в нашем материале «Напророчили»).
Хотя ученые научились предсказывать структуру белка, получать искусственные белки с заданными свойствами по-прежнему непросто. Например, известно, что в живых организмах некоторые белки способны изменять свою конформацию в ответ на внешние воздействия — в том числе на изменение концентрации ионов. Хотя этот механизм распространен в природных белках, реализовать его в искусственных белках с помощью