Секвенирование ДНК из воздуха сообщило о составе биомов и человеческих популяций
А также выявило патогены, аллергены и психоактивные растения
Американские и европейские исследователи продемонстрировали пригодность глубокого секвенирования ДНК методом дробовика в окружающем воздухе для быстрого и неинвазивного анализа биомов, человеческих популяций и патогенов. Им удалось получить из образцов ДНК в воздухе самую разнообразную информацию: от присутствия аллергенов и психоактивных растений до филогенетического происхождения местной популяции рысей и гаплотипов населения. Отчет о работе опубликован в журнале Nature Ecology & Evolution.
Скорость, мощность и портативность оборудования для глубокого секвенирования постоянно растет, одновременно с этим совершенствуются методы выделения ДНК из различных образцов окружающей среды (средовая ДНК). Это открывает большие возможности для анализа биологических видов и других генетических особенностей местности. Одним из быстро развивающихся инструментов мониторинга биоразнообразия служит анализ ДНК в воздухе. В основном для этого используется прицельный метод метабаркодирования, который определяет виды по небольшим (до нескольких сотен пар оснований), но высокоспецифичным последовательностям ДНК. Его использование требует предварительного секвенирования геномов интересующих видов и составления соответствующих библиотек, при этом генетическая информация о виде в образце ограничена этими небольшими последовательностями.