Беспозвоночные украли эпигенетическую метку у бактерий
Группа ученых из США обнаружила в геноме коловраток из рода Bdelloidea N4-метилцитозин — модифицированный нуклеотид, который раньше считался характерным только для бактерий. Авторы предполагают, что скопление N4-метилцитозинов в областях, содержащих транспозоны, может быть одной из причин относительно медленного размножения мобильных генетических элементов в геноме этих организмов. Статья, рассказывающая об исследовании, опубликована в журнале Nature Communications.
Эпигенетические метки — это ковалентные модификации нуклеотидов, которые позволяют записать в геном некоторую дополнительную информацию. У бактерий эпигенетические метки встречаются в основном в системах рестрикции-модификации, которые позволяют отличить «свою» ДНК от ДНК бактериофага.
У эукариот модификации нуклеотидов обычно регулируют экспрессию генов и препятствуют распространению транспозонов — последовательностей, способных к самостоятельному перемещению внутри генома. У эукариот встречается два основных типа эпигенетических меток: это цитозин с метилированным C5-атомом (5mC) и аденин с метилированным N6-атомом (6mA). У бактерий обычно встречается цитозин, метилированный по N4-положению (4mC), и до недавнего времени считалось, что у эукариот такая модификация не встречается.
Группа ученых под руководством Ирины Архиповой (Irina Arkhipova) из Морской биологической лаборатории обнаружила, что N4-метилцитозин встречается не только у бактерий, но и у коловраток из класса Bdelloidea. Эти беспозвоночные известны своей способностью включать в свой геном чужеродные гены (8–12 процентов белок-кодирующих генов этих животных имеют бактериальное происхождение). Биологи обнаружили у представителя этого семейства коловратки