Профиль РНК поможет понять причины заболеваний головного мозга
Биологи из Великобритании получили полный транскриптом клеток коры головного мозга. С помощью секвенирования третьего поколениями специалистам удалось обнаружить изоформы РНК генов, связанных с развитием нейродегенеративных и психиатрических заболеваний. Статья опубликована в журнале Cell Reports.
С развитием некоторых заболеваний головного мозга, таких как болезнь Альцгеймера и шизофрения, связаны нарушения в клетках процесса, который называется альтернативный сплайсинг. Альтернативный сплайсинг — нормальное явление, которое затрагивает 95 процентов всех генов. В результате него один ген дает начало нескольким разным РНК-продуктам.
РНК, прежде чем выйти из ядра и начать выполнять свою функцию (чаще всего — матрицы для синтеза белка), должна пройти через созревание. Сплайсинг — один из этапов созревания РНК. При сплайсинге из РНК вырезаются некоторые нуклеотидные последовательности, а оставшиеся — сшиваются между собой. За счет вырезания разных комбинаций последовательностей из одного транскрипта может получиться несколько разных зрелых РНК — изоформ.
Получение полного репертуара последовательностей РНК (включая продукты альтернативного сплайсинга) в клетках головного мозга могут помочь установить причины таких заболеваний как уже упомянутые болезнь Альцгеймера и шизофрения. Но до недавнего времени получение полного транскриптома было ограничено существующей